崇祯十三年，三十岁的方以智中进士，选为庶吉士，有人向崇祯皇帝推荐方以智，崇祯召对德政殿，方以智“语中机要，上抚几称善”。后在京任工部观政、翰林院检讨、皇子定王和永王的讲官。
四年之后，李自成农民军攻入北京，崇祯皇帝自缢，方以智在崇祯灵前痛哭，被农民军俘获，农民军对他严刑拷打，但他始终不肯投降。不久，李自成兵败山海关，方以智侥幸乘乱南逃，大难不死。当方以智在北京誓死不降农民军之事传入江南时，友人皆把他比拟为文天祥。
方以智辗转奔向南京投奔南明弘光政权，仇敌阮大把持南明弘光朝政，不断受到排挤、迫害，于是不得不改名吴石公，流寓岭南、两广一带以卖药为生。不久，南明隆武帝以原官庶吉士相召，方以智不应，取名“三萍”，浪迹于珠江山水间。
随后桂王朱由榔称帝于肇庆，在父亲的朋友瞿式耗的引荐下，方以智参与了拥立永历政权的活动，任左中允，少詹事，翰林院侍讲学士，方以智很快便觉桂王政权朝不保夕，名不符实，内则门户纷争，奸人当道，外则与广州绍武政权同室操戈，兵戎相见。永历更是胆小如鼠，稍稍闻风鹤即奔走靡常，这一切使方以智心灰意冷，后被人诬劾免职，不得不遁迹于少数民族聚居地湘、桂、粤西一带，过着“曲胘茅屋鸡同宿，举火荒村鬼作邻”的生活。
当清兵大举南下时，他曾联络东南抗清力量抵抗。清兵攻陷广西平乐，方以智被捕，清军在方以智的左边放了一件清军地官服，右边放了一把明晃晃的刀，让方以智选择。方以智毫不犹豫，立即奔到右边，表示宁死不降。满清将领相当欣赏他的气节，于是将他释放。获释后披：u为僧，改名弘智，字无可。
明末五大科学巨匠中，方以智、李时珍、徐光启、徐霞客、宋应星曾被后人并列，其中方以智曾所著的《物理小识》尤为杰出，可算是明末的科学巨著，朱骏也正是因为接触过《物理小识》才记住了方以智，大明光复江南之后，朱骏便派出锦衣卫四处寻访，便是想借助这个堪与牛顿媲美地科学巨匠请来担任一项相当重要的职务。
朱骏知道，方以智之所以说出‘一别经年，皇上已不是从前地那个的皇上’这句话并不是另有所指，早在十年前方以智便是永历皇帝地拥护登基之一，之后才黯然拂去，如今的朱骏站在方以智面前，自然会说出皇上已不是从前的那个皇上地话来，只是这个皇上只是从前那个贪生怕死的永历，如今在方以智面前是个脱胎换骨、历经图强地中兴君王。
朱骏携着方以智的手，在大批官员地羡慕之下登入衙堂，朱骏坐在上座，从人给方以智搬来锦墩，广东的地方官员只能站在两侧，朱骏开口便问：“方先生的物理小识朕是研读过地，受益良多，如今才知道先生高才，这一次特意请先生来，便是希望先生能够入朝为官，为大明中兴，为天下百姓做些事。”
《物理小识》全书共十二卷，分为十五类，依次为天类、历类、风雷雨电类、地类、占候类、人身类、医药类、饮食类、衣服类、金石类、器用类、草木类、鸟兽类、鬼神方术类、异事类。从内容来看，它广泛涉及天文、地理、物理、化学、生物、医药、农学、工艺、哲学、艺术等诸多方面。
《物理小识》的价值并不仅仅表现在它的实用性方面，也表现在它独特科学见解。方以智在该书中提出的许多真知灼见。在天文学方面，《物理小识》继承了中国传统天文学的优秀成果，并且吸取了当时西方传入地先进知识。例如该书认为“地体实圆，在天之中。……相传地浮水上，天包水外，谬矣。地形如胡桃肉，凸山凹海。”
中国传统上一直认为天圆地平。明末，传教士来华，带来了地圆学说，为一部分中国知识分子所接受，方以智是其中之一。他所说的“地形如胡桃肉，凸山凹海”一语
地说明了海也是地球地一部分，这有助于破除传统的上”之说。
在物理学方面，《物理小识》更是多有可称道之处，尤其表现在它所论及光学和声学知识方面。《物理小识》对于光和声的波动性的认识，远较其前人为强。书中提出了被我们称之为“气光波动说”地朴素光波动学说，方以智并在此基础上阐释了他的“光肥影瘦”主张，认为光在传播过程中，总要向几何光学地阴影范围内侵入，使有光区扩大，阴影区缩小。
他并据此批驳了传教士有关太阳直径将近有日地距离三分之一大的说法。这些，都是前无古人地学术贡献。
另外，《物理小识》关于光的色散、反射和折射，关于声音的生、传播、反射、共鸣、隔音效应，关于比重、关于磁效应等诸多问题的记述和阐，都是极其出色的。
在医药生物诸方面，《物理小识》也有诸多贡献。方以智在这些方面用力甚大，有关条目占全书总条目的三分之一还要强。他会通中西，对人体生理、病理以及医疗、药物等诸多方面均有较深入的研究。方以智重视吸收引进西方医学知识，以弥补传统医学的不足。他在《物理小识》中介绍了大量西医解剖学知识，而这正是传统医学的一个薄弱环节。他根据西方人体生理知识，提出“人之智愚系脑之清浊”，这是对传统“心之官则思”说法的一个勇敢突破。方以智对传统医学也很精通，《物理小识》曾广泛援引历代医家言论，取各家之长而加以综合。在药物学方面，《物理小识》不但现和改正了一些历代本草书包括李时珍《本草纲目》中的错误和疏漏。
方以智接受西方科技知识，并非盲从，而是经过自己的认真思考、消化。例如他对于西方地圆说，就是先考察了地圆说赖以成立的观测证据，然后才加以接受的。对于传教士的错误说法，他则予以批驳。例如传教士曾说，太阳半径为地球半径的１60多倍，而太阳距地球只有１600多万里，方以智指出这是错误的，并且亲自推算地球圆周长约9万里，比之西方更为精确。
朱骏最佩服的并不是他明了什么，而是老家伙对近代天文、地理、化学、生物、医药、农学、工艺、哲学、艺术等方面统统有所涉及，单止这一点，便足够朱骏引起兴趣。
“皇上相召，微臣虽风烛残年，臣敢不效死力？”方以智绝对不是个含糊的人，当年为了抗清，他上蹿下跳，乃至于跑到深山去感召土匪出来抗清，就算是被人诬陷，离开了朝廷，还在到处联络抗清力量，大声疾呼。
朱骏笑道：“朕打算给你亲自制定一个官名，嗯，叫科学院祭酒吧，从此之后六部九卿改为六部十卿，正二品，如何？”
“科学院？”方以智道：“皇上，敢问这科学院署理的是什么事物？”
朱骏道：“天文、地理、格物、工艺、农学无所不包，只要有擅长专学，都可入院研究，国库每年按时提供经费，科学院还可设置奖励，但凡成绩突出或研究出实物的学，都可配勋章，给予奖励，朕在南京新都已下令建设科学院，其规模与翰林院相等，朕取士不看文章，不问八股，只看是否有独到的学识和技艺、专业本领、特殊才能。科学院下设十司，一为天文司，二为地理司、三为物理司、四为化学司、五为生物司、六为医药司、七为农学司、八为工艺司、九为哲学司、十为艺术司。每司设主事一名，从三品衔，各司有侍读、侍讲、再征募奇能之士入院为博士、修撰、编修、检讨等官。”
方以智垂坐锦墩之上，一副道貌岸然的高僧之相，可是心里却扑通扑通的狂跳，眼眸中闪露不出的狂喜，他并非在乎名利，经过这么多年的坎坷，从一个倜傥的风流少年变成了行将入木的老人，名利早已是过眼云烟，只是皇上要新建的科学院却让方以智的心热乎起来，他原本是儒学世家，后来猎及西学，研究各种学术，如今让他接掌科学院，实在是大慰平生所愿，最重要的是，皇上将科学院提升到与翰林院同等的地位，这就是说，大明的取士之道恐怕要变了。
方以智突然开眸，脸上的褶皱也显得光滑了不少，仿佛一下子年轻了不少，他站起来顿了片刻，随后用手一扯，脱去身上的袈裟，现出袈裟内的内衣马裤，肃然的朝着朱骏道：“皇上，微臣这和尚不做了，今日便退封度蓄还俗，这科学院祭酒是否可以立即上任？”
方以智的行为在衙内的文武官员眼里就显得有些‘大逆不道’了，不过朱骏倒并不以为意：“你先和朕到江南、岭南走一走，再回海都去择选一些良才，等迁都时再走马上任吧，方爱卿，朕听说你还有个儿子名叫方中通是吗？他也曾出过一本《数度衍》的书，熟知天文历算，方爱卿年纪大了，朕便下旨召方中通将来一道去南京，也在科学院任职吧。”
方以智显然是个六根不太清净的和尚，说到儿子脸上又红润了一些，方家传世六代以来，简直就是大儒的授精气，一个比一个学问大，代代都有人出书，从儒学、易学到心学、西学，猎及到什么就玩什么，还玩的十分熟稔，随便出一部书都是传世之作，开历史之先河。
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今天介绍个牛B的人物，可能会有些无聊，但是这个老家伙确实厉害，全家都厉害，多介绍一下。
第四百零五章：缺德
广东视察了一番，带着新捡来的宝贝方以智，朱骏的陆路北上，途径江西、浙江、江苏而去。
与朱骏的好心情所不同的是，此时的北京城却是一片哀鸿，江南乃是鱼米之乡，又是每年粮饷漕运的主要征集对象，如今江南不保，满人的统治区域只剩下长江以北地区，上百万的满人又都不事生产，供耕种粮食的土地又不够多，如今山西、河南大旱，山东又出现了瘟疫，赤地千里，不但满人、就连辽东、新疆、陕西等地的大军都只能节衣缩食，早已引起了极大的不满。
至于救灾，康熙连想都没想，山西、河南大旱、山东瘟疫，这三省受灾的百姓足有百万，如今朝廷连军饷都捉襟见腹，连京城里的满人都要节衣缩食，若是运粮赈灾，恐怕兵变就要四起了。
可是不赈灾又不成，康熙并不蠢，也知道何不食肉的笑话，百姓没有了饭吃，可是要造反的，当年明亡于流寇便是陕西连年大旱的结果，如今风水轮流转，他康熙也遇到了当年崇祯一样的问题，不同的是，崇祯或许还能匀出一丁点余粮前去赈灾，可是他康熙是空空如也，一点儿都没了。
康熙怒气冲冲的听着索尼等人的禀告，山西、河南几乎是颗粒无收，赤地千里，如今省境已聚集了数伙反贼四处劫掠，攻夺城池，山西、河南巡抚勒令绿营镇压，好不容易维持了局面，可是镇压只是治标，没有粮食，今日杀了一万个反贼，明日又有一万不怕死的反贼跳出来，防不胜防。
更严重地还是山东，前年刚生了蝗灾，如今又是瘟疫流行，感染数以万计，当地的衙门根本就应付不过来，再这样下去，恐怕整个山东都要陷入瘟疫之中了。
“饭桶，饭桶。”康熙忍不住拍着御案：“山东巡抚杨文成上个月是怎么说的？他捂住疫情不报，却在密折中声称天下太平，如今瘟疫传到了济南，这才上奏，他……”康熙一口气提不上来，噎的连连咳嗽了几声，道：“去，派人去山东宣旨，摘去杨文成顶戴花翎，押赴京城交大理寺治罪，不能轻饶。”
班中站出一个人来，此人乃是索尼的儿子索额图，自从康亲王杰书去了辽东整顿军务之后，康熙便更加倚重索尼了，可索尼年纪老迈，眼看就没了几年活头，康熙便提拔了索额图做了吏部尚书，一来显示自己对索尼地恩宠，二来也是让索额图接索尼的班的意思，在康熙四年时，为了笼络索尼对付鳌拜，康熙迎娶了索尼的孙女也就是索额图的女儿赫舍里氏为皇后，索额图说起来还是康熙的老丈人呢。
索额图做人十分谨慎，虽是康熙地丈人，却从不倚老卖老，在康熙面前低眉顺眼的，让曾经饱受鳌拜折腾的小皇帝看的很是顺眼，索额图清了清嗓子才道：“皇上，微臣以为不可。”索额图谨慎的望了康熙一眼，见他脸色如常，并没有怪罪的意思，才道：“杨文成虽然犯了大过，可他对皇上是忠心耿耿，皇上若是派出钦差，他畏罪之下说不定会……”
索尔图没有再说下去了，康熙已经平静下来，他自然知道索额图的意思，一旦怪罪，杨文成若是畏罪，说不定就降明去了，有道是疯狗跳墙，一旦把人逼的狠了，谁知道会闹出什么更大的乱子出来？如今又不是太平盛世，有些事并不是他康熙�
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