投降之后，他命令程学启驻营于里边那条壕沟之内，充当抵御城内太平军的先锋。同时，湘军大营的火炮，全都对准了程学启部，稍有异动，就先把程学启炸个稀烂。他还担心这些防护措施不够，每天只发给程学启部一日的水米，让程学启困窘不堪。
沦落到这个地步，程学启尴尬不已，天天晚上蹲在营帐痛哭，好多次想拔刀自杀，都被亲兵统领丁汝昌把刀抢了过去。
为了表白诚意，程学启再三请战，终于打动了曾老九。不想这时候曾国藩和胡林翼这两个圣人双双来信，叮嘱曾老九绝对不要轻信程学启。而且，湘军营中诸将几乎都吃过程学启的亏，被程学启打得没个人样，此时想杀程学启报仇，就力劝曾老九冲程学启开炮，闲着也是闲着，先打死他再说。
而城中的太平军守将叶芸来，也玩了一招狠辣的。他把程学启的妻子——也就是叶芸来自己的小姨子——拖到城头上，当场宰杀。同时杀掉的还有程学启的孩子，然后将头颅悬挂在城头上，让程学启看着痛苦。
事情弄到这个地步，最早献计摆平程学启的桐城老儒生孙云锦，心里受不了了，情愿以全家老小性命为担保，保程学启不反。而程学启也断了骨肉之情，立誓灭贼报国，想出来一招北门穴地攻城之计，并亲自带着丁汝昌等步卒，攻陷安庆北门，断了太平军的粮道，此后又是他第一个杀入安庆城中。
战事结束后，舒城的高崇善找来了，说：贤婿啊，我有三个女儿，二女儿是你妻子，让大女婿叶芸来杀了，现在你又把你连襟叶芸来给杀了，你看这事闹的……要不然这样吧，我再把小女儿嫁给你，干脆我们一家全死在你手里算了，你看好不好？
于是程学启又娶了小姨子，此后他必须要吸取教训，不能连累这个小姨子兼妻子再被人杀掉了。不然的话，他程学启的人生，未免太失败了。
安庆之战，程学启总算是赢得了曾国藩的认可。但是，由于双方最初的龃龉，关系始终处理得不好，程学启时不时和曾家人闹点儿矛盾。总之是曾家人看到他程学启就不舒服，他程学启待在湘军里，也是如坐针毡。可天下之大，又实在没他落脚的地方，也只能硬着头皮撑着。
李鸿章却是观察双方好久了，趁此淮军成立之际，他向曾国藩提出，让程学启转隶淮军。曾国藩想了想，知道程学启留在自己这边也是双方都不舒服，就答应了下来。
李鸿章大喜，立即派人去通知程学启。
却不想，程学启一口回绝了李鸿章。
官场上的两种类型
程学启拒绝归附李鸿章，让李鸿章始料未及，为之错愕。但他终究是个聪明人，略一想就明白了。
恐怕程学启的心里，做梦都想跳槽到淮军这边来。他本是淮上人氏，待在湘军那里，又处处不如意。李鸿章这边却全都是淮上子弟，是程学启最渴望的地方。但问题是，曾氏兄弟本来就疑忌他程学启，如果这时候他急切要走，恐怕激怒曾氏兄弟，偏偏不放他走，谅他程学启也无计可施。
所以，程学启不想转隶淮军是假的，真实的目的，是希望李鸿章替他把事办利落了。
想明白了这一切之后，李鸿章又苦思冥想，给曾国荃写了封信，尽量淡化程学启转隶的意义与价值，并再次表态，自己永远是曾老九的先锋官。
曾老九见信，被李鸿章的文笔打动，遂答应放程学启走。程学启欢天喜地，拉着队伍来到安庆，从此投奔了李鸿章。
1862年3月4日，曾国藩在李鸿章陪同之下，检阅了淮军。这一天，标志着淮军正式成立。
检阅过后，曾夫子发布了一道诡异的命令：命李鸿章所部淮军，开赴镇江，与冯子材会合。
为什么要开赴镇江呢？
摆到桌面上的理由，是从安庆到上海，距离遥远，而且中间还隔着太平军控制的大片区域，所以淮军只能绕路而行。另外，太平军为了解南京之围，一边攻打上海，一边不时敲打守在镇江的冯子材。小老弟冯子材一夜数惊，招架不住，频频向安庆求救。所以曾国藩考虑：要不上海再说吧，还是先援救镇江吧。
介于摆到桌面上与没摆到桌面上之间的理由，是往援镇江比往援上海更有利于整体战局，可以锁死南京城的外围，更易于攻下南京城。毕竟，只要攻下南京城，太平军失其首脑，基本上来说就没咒念了。
没有摆到桌面上的理由，是为了等曾国荃醒过神来，放弃屯兵南京城下的短视做法，赶紧回来接收这支强大的武装力量。在曾国藩的心中，排第一位的永远是他亲爱的弟弟，李鸿章排得也不靠后，但肯定是排在曾国荃的后面。所以曾国藩心目中淮军的建制，是以曾国荃为帅，以李鸿章为副手。
曾老师的命令，李鸿章能够拒绝吗？
他能。
这时候的李鸿章才把一个石破天惊的消息告诉曾国藩：上海那边，急切等待着淮军的到达，为此，沪上乡绅父老准备凑足十八万两银子的巨款，雇用火轮船来接淮军，穿越由太平军控制的长江水域，将淮军运往上海。
直到李鸿章说出这件事，曾国藩才知道，他心爱的弟子都瞒着他干了些什么！
李鸿章有可能是已经收服了上海来使钱鼎铭，也可能没有。但无论有没有，钱鼎铭都在做着一件有利于李鸿章的事情。唯恐这支刚刚建立起来的军队不能如愿抵达上海，钱鼎铭不知何时已经悄然溜回了上海，开始谋划这件事。
当钱鼎铭回到沪上之时，苏松太道吴煦收到曾国藩的书信，信上称：若尊处能办火轮夹板等船前来迎接，则水路行走较速；若无船来接，则须由陆路穿过贼中，循和州、天（长）、六（合）而达于扬、镇。
要知道，此时淮军总计是六千五百人，以当时的航运能力，这么多人走水路，根本是不现实的。就算是能够找到数目足够的船只，也凑不足数目如此庞大的运费。所以曾国藩虽然要求对方最好能走水路，但实际上淮军最终的目的地，只能是扬州和镇江，终究是不会脱离他老人家的手掌心。
事实上，曾国藩所料丝毫也没错。苏松太道吴煦，最初是考虑雇用洋人的火轮船，将淮军接到上海。但是通商大臣薛焕否决了这个议案，理由是这个议案太花钱了，弄不来那么多钱，还是算了吧。
薛焕虽然是通商大臣，但此时新任巡抚未到，他仍然兼着江苏巡抚的职务。听了他的话，吴煦也动摇了。
这时候，却跳出个顾文彬。细说这个顾文彬，也不是横空跳出来的，最早把林则徐的弟子冯桂芬推出来策划乞兵的，就是这个顾文彬。此人是当时有名的诗人、画家，也曾在朝廷刑部任职。推究起来他是上海城中最有眼光的人，知道必须要快一点儿把淮军接过来。所以他再三游说吴煦，最终逼得吴煦不得不去找薛焕，当面摊牌。
薛焕道：已经说过不行，你怎么又提这事？
吴煦道：老薛啊，你就别固执了，就算你替我想想好了。你现在没有了守土的职责，当然是一身轻松。我老吴可惨了，倘若太平军攻入上海，第一个死的，可就是我啊。所以一定要快点儿把淮军接过来。
薛焕道：甭想了，不可能的事儿。
吴煦：必须这样做，不这样不行。
薛焕：我看过你们的预算，要把淮军接过来，要花十八万两银子。我来问你，哪去弄这么大的一笔钱？
吴煦：这事由顾文彬来解决。
薛焕：顾文彬？那个诗人？画家？六扇门的捕头？你不是开玩笑吧？
吴煦：生死攸关，谁敢在这时候开玩笑？
薛焕：顾文彬怎么会有这么多的钱？
吴煦：他也没钱，不过他去找洋人贷款。
薛焕听后，沉默良久，终于点头应允。
事情到了这一步，往后还有一个诡异的变局。在这里，我们看得清清楚楚，是苏松太道吴煦坚持快点儿把淮军接过来，而通商大臣薛焕反对。后来李鸿章到了上海，薛焕却和李鸿章处得极好，他家里有两个女儿，一口气全都嫁给了李鸿章大哥李瀚章的两个儿子。反倒是坚持迎请李鸿章的吴煦，成了李鸿章的敌人，惨遭李鸿章修理打击。
何以会有这种变局呢？
这是因为，薛焕与吴煦，两人在智商和情商上存在着一段无可弥补的差距。薛焕其人，智商高情商也高，起初不答应用洋火轮接淮军入沪，是因为他不想承担任何责任。只要需要他承担责任，就甭指望他能答应。除非不需要他承担责任，这种情况下他才肯做顺水人情。李鸿章入沪之后，薛焕立即发现，李鸿章各方面的才能都在他之上，早晚必然飞黄腾达，所以立即在第一时间冲过去，和李鸿章站在一起，并分享胜利果实。
薛焕是一个精明的官员，而吴煦却是最典型的笨官。这种官员，工作都是他来做，麻烦都是他来承担，最后还不讨上司欢心，惨遭修理。究其原因，是因为如吴煦这种人，缺乏对外部世界的观察能力，分不清孰高孰低。如吴煦，明明是他把李鸿章接过来的，却硬是看不出李鸿章的过人之处，反而在小事上给李鸿章添堵，结果惹火了李鸿章，遭到了李鸿章不客气的修理。
精明的薛焕与憨头憨脑的吴煦，是官场上最常见的两种类型。任何人只要稍微加以留心，保准会在你的周围，发现这两种人。
吴煦与李鸿章之间的纠斗，是以后的事情。眼前的事情是，曾夫子发现李鸿章为了逃脱他的手掌心，竟然以既成事实的方式强迫他就范，盛怒之下，曾国藩发火了，他回到屋子里，把门一关，不再搭理李鸿章。
李鸿章的后手
李鸿章居然敢算计自己的老师，是因为他早就有了后手。他清楚，曾国藩一旦知道上海那边的洋火轮已经准备就绪的时候，肯定会怒不可遏，不放淮军离开。所以等这事发生的时候，李鸿章的后手就立即施展了出来。
李鸿章的后手，共分两步。
第一步，是他跪到老师面前，再三解释上海雇用洋火轮的事儿不是他的主意，而且他本人也不同意这个方案。理由是，乘夷船越贼境，太不安全。
作为佐证，李鸿章举例说，如今湘军幕府之中，对于淮军赴沪之事，议论蜂起，说什么的都有。所以他不可能接受如此危险的方案，建议老师再寻找一个更妥善的法子。
听李鸿章这么一说，曾国藩也不好意思了，觉得自己太小心眼儿。好歹自己也是圣人啊，不能流露出过多的私欲，让人耻笑。于是他消了气，坐下来，和李鸿章商议出一个新的折中方案。这个方案，就是仍然走陆路，让李鸿章率淮军，循北岸逶迤前进。途中尽量避免与太平军相遭遇，就这样悄无声息地一路溜到上海去。
这个方案听起来极尽离奇，但用兵之妙，走的尽是让对手意料不到的怪招。更何况，此前曾国藩也有类似的成功案例。比如说湘军水师统领彭玉麟，其人原本是个书生，曾国藩筹建水师的时候，打算以彭玉麟为帅，由是书生彭玉麟易装为乞丐，穿越了由太平军控制的漫长水道，顺利抵达湘军大营，从此由一名翩翩文士，转型为凶悍的湘军水师统领。
曾国藩想出这个法子，多半是他突然想起来李鸿章曾和彭玉麟动手打过架，所以他不由自主地进入了一种思维定式，将当年彭玉麟的成功案例移植过来。心里所抱有的期望，是希望李鸿章也能够像彭玉麟那样，从此成为曾老师最好的助手。
但是曾国藩低估了他这个得意弟子。李鸿章之所以推出这么一个怪异方案，其目的是暂时给曾国藩一个心理缓冲，以便在他最后出手之时，能够让曾国藩接受现实。
对曾国藩的最后一击，来自素有烈士情结的沪上名士钱鼎铭。
1862年3月28日，钱鼎铭在另一位沪上名士潘馥的陪伴之下，自上海坐轮船重返安庆，带来了一个让曾国藩始料未及的消息：沪上已经凑足了十八万两银子的巨款，和麦李洋行签了货运合同，七艘洋火轮不日即将抵达安庆，准备分三批，将六千五百名淮军接到上海。
听到这个消息，曾国藩当时就急了，一口拒绝：不可以。
为什么不可以呢？钱鼎铭眨着纯洁的大眼睛，很无辜地问曾国藩。
因为……这个方案太草率了，太不安全了。现在曾国藩能够想到的，只有这么一个理由了。
这时候钱鼎铭使出了他的撒手锏，往曾国藩面前一跪，号啕大哭起来，哭曰：江苏官绅殷殷请援之意，有甚于蹈水火者之求救，其雇洋船来接官兵，用银至十八万之多，万不可辜其望，拂其情……
这是钱鼎铭二哭曾国藩。头一次，他是央求曾国藩派救兵往援上海，而这一次，他是哭求曾国藩答应他的运兵方案。
目前的史书，但凡提到钱鼎铭，都有这样一句话：钱鼎铭因为赴安庆求救兵，效春秋申包胥哭秦廷之举，终于打动曾公，让李�