“法国铁路系统完全处于一片混乱之中。盟军成功地把整个的调车场炸成废墟，炸毁了无数的机车；数十个车站处于瘫痪状态。盟军飞机驾驶员所不能做的别的破坏工作也由富有经验的破坏小组做到了。人民，特别是巴黎市民的愤怒情绪正在高涨，因为在那里买不到食品，谁也不能外出旅行，而且电的使用也受到严格限制”另据报道，到5 月份的第三个星期已有六千零六十二个平民在空袭中被炸死。
莫罗拒绝继续再为铁路研究所工作。他在英国一直等到法国解放后才回国。战后过了很长一段时间，邓德代尔收到法国全国铁路局寄来的一封信，说莫罗在铁路服务四十年之后已经退休并申请退休金。信中指出，不幸的是在1944 年春天有一段时间他中断了工作，而他本人不能对此做出令人满意的解释。他要求法国铁路局到外交部了解情况，他什么都不能说。邓德代尔也不能讲。英国情报局并未作为一个组织正式存在过，因此也不能说它雇用过任何人。此外，邓德代尔不敢断定，如果法国全国铁路局发现了莫罗在战时法国铁路遭受破坏中所起的作用，他的话对莫罗是否能领到退休金会产生什么影响。
“运输”计划只是盟军在登陆日之前发动的大规模空中战役的一方面。
正如大西洋海战是要消灭德国的海军一样，空袭的目的是要消灭德国空军，同时把为德国战争机器提供物资的工业城市从地图上抹掉。1943 年潜水艇的威胁实际上已经消除，盟军在北非也取得了胜利这样这场空中战役，就在盟军的日程表上占据了最优先的地位。因为德国空军给“尼普顿”计划的实施造成双重威胁。盟军的策划者们担心，即使只有少数几架德国飞机，也可能在拥挤的海道上和“尼普顿”计划规定的强攻地区的登陆场造成大破坏，就像它们在已里所做过的那样。而且德国空军至少有5 个完整的空降师，可能在英国南部一些港口，在伦敦或登陆场地区实行密集空投来挫败“尼普顿”计划。战后确实发现戈林早已制订了这样的计划。如果德国人当时能预先知道盟军进攻的时间和地点，如果德国空军当时拥有向目标运送空降部队的运输机，如果盟军当时未能取得制空权，未能在运载伞兵的机群还没有到达其要开始行动的法国基地之前就消灭它的话，这项计划就很可能付诸实施了。
然而，空战的胜利并不是单纯地取决于哪一方的飞机最多，还有其他一些迫切的需要使盟军的伤亡保持在最低限度，而且不让德国人知道“尼普顿”计划的真象也是重要的。“尼普顿”计划是可以通过大规模进攻前空战的形式和强弱程度推测出来的。德国的空军情报机构很大，富有经验并且极为能干，它存在的唯一目的就是要挫败盟军的空袭。通过对盟军战术、队形和目标的侦察，通过密码分析和无线电侦察活动以及遮蔽或干扰雷达系统和无线电导航仪的技术，这个情报机构有预测，或许甚至制止“尼普顿”计划的实现的手段：这样，欺骗，特别是虚构的“坚韧”计划，就成为支配大举进攻前的空战的主要因素。空战本身是一种新的战争，它产生了许多像陆战或海战一样巧妙而无情地对付敌人的策略。
首先是有计划有步骤地蒙蔽德国无线电情报系统的活动。众所周知，德国人监听了盟军空军无线电通讯并从通讯方式的某些特点推断盟军正在酝酿一场大规模的进攻。因此，盟军就广播虚假的无线电通讯使德国人经常处于毫无必要的戒备状态；而且在“尼普顿”计划的特殊背景之下，在大规模进攻前演习的同时，广播那些与登陆日前夕的真实的无线电通讯相似的虚假的无线电通讯，希望使敌人断定：“尼普顿”计划本身只不过是又一次演习。
这种无线电欺骗还用清晰的或易破译的密码播出，使德国人认为他们已截获了一件泄密的重要情报。不过这是人们所熟知的一种计策，所以很少使用，以免德国人识破这种极易得到的骗人情报的真相。
空中战役的战略家们清楚地知道，虽然敌人看不到在英格兰发生的事情，但肯定能听到，因此就开始广播假无线电通讯，透露或者像是在透露盟军空军力量主要集中在东英吉利的平原上，即“水银”计划地区，而英国西南部的真正的飞机中队却保持沉默或用陆上通讯联系。美、英飞机还在进行真的室袭的同时执行欺骗飞行任务，发出假无线电通讯暗示它们的起飞和返回地点是东英吉利。但是，无线电欺骗战的最重要的策略就是使德国无线电情报系统完全淹没在大量的假通讯之中。并且为了加重德国情报系统的负担，盟军空军还有计划有步骤地攻击位于“尼普顿”计划和“坚韧”计划地区的所有无线电台。最后用一百架“兰卡斯特”飞机对位于西北欧瑟堡附近菲尔姆德乌尔的德国通讯情报总局进行密集轰炸，这次空袭卓有成效，正如后来的摄影报道的说明所说：“电台已经完全不能使用。它的地址本身如果不花大力气平整弹坑的话是不适合重建电台设施了。”这一次以及其他次对德国无线电台的空袭还有另外一个目的。这样就使秘密通讯更加容易遭到“超级机密”的破坏。同时，马基也在忙于切断通讯电缆，这又迫使德国人不得不采用无线电通讯。
也许盟军的最残忍的空中策略是目标的选择。在把西部欧洲的铁路中心炸成废墟的同时，盟军空军还轰炸公路和铁路桥梁。但是为了暗示大举进攻的地点是在加来海峡，在大学进攻日开始之前只轰炸塞纳河上的桥梁。卢瓦尔河和其它河流的桥梁留待以后轰炸，这样，1944 年4 月21 日至6 月5 日。
从鲁昂至巴黎之间塞纳河上的桥梁全部被炸塌坠入河中。隆美尔曾目睹一次这样的轰炸，当时在维农的塞纳河上，美国第九航空队的八架“霹雳”轰炸机用八吨炸弹炸毁七百二十五英尺长的钢梁铁路桥。共有三十六座大桥遭到同样的命运。海岸炮兵阵地、雷达站、飞机场、坦克停车场、汽油和石油库、司令部（为执行“超级机密”计划的目的而建立的司令部除外），特别是飞弹武器发射场也都被炸毁。由于这些目标大部分都在“坚韧”计划地区，因此，炸毁这些目标极巧妙地达了欺骗的目的。一份题为“欧洲战场空军行动的掩护和欺骗”的绝密备志录总结了这次战役的基本策略。这份备忘录说，由于“不让对方从轰炸强度或方式中看出进攻的预定日期和目标区是绝对重要的，因此，对加来海峡的海防设施（掩护区或虚构进攻区）也同样地进行轰炸，而且有时对这些地区的轰炸猛烈程度甚至两倍于对诺曼底的海防设施的轰炸。”如果在突袭地区内投一磅炸弹，那么在这地区之外就投两磅炸弹。
由于德国在加来海峡的防空设施比其他地方坚固得多，所以，这种策略会使盟军飞行员的伤亡人数大为增加。
向比利时和法国北部地区的抵抗运动运送供应物资的空中行动及在敌占区上空进行侦察飞行也采取一样的方式。在进攻前的整个时期内，向“坚韧”计划”地区运送补给品的飞行次数超往诺曼底运送补给品的飞行次数，两者的比例是二比一或三比一，而在上空的假侦察飞行是一样的频繁。当然侦察驾驶员自己也不知道哪个地区是掩护区，哪个地区是真正的目标，虽然“掩护和欺骗”备忘录指出，上级也许是要使这些驾驶员相信加来海峡是突袭地区，以防他们被击落而受到讯问时泄露机密。可以认为，这些行动也造成了伤亡的增加。这种伤亡的增加，一部分应当算在“坚韧”计划的帐上。
盟军究竟愿意花多大的代价以打败德国空军、严守“尼普顿”计划的机密呢？在空袭亚琛、哈塞尔特、儒维西、利尔和特拉普斯的铁路中心的空袭中，盟国的损失特别严重。这一次引起了人们的猜测，认为盟国也许是故意事先让德国得到空袭情报以引诱德国空军出来作战，温盖特回忆说，皇家空军准备把最新式的“喷火”战斗侦察机送给德国人，以玩弄一场骗人的把戏。
这是梅耐待查根策略和“肉馅”行动的变样。有一次，一个被俘的德国战斗机驾是员被带到苏格兰卢哈劳动保护皇家空军基地受“审讯”。这个人以“暴君崇拜”和高超飞行技术著称。负责审讯这个俘虏的皇家空军情报官在讯问的中途离开了，他说他“去找一个人谈狗的事情”。几分钟后，皇家空军地勤人员把“喷火”战术机开到这个俘虏的视野之内。他们给飞机加了油，盘动一下螺旋桨，然后大喊一声“小卖部车来了”，就去喝茶了。这架天篮色的飞机线条极其美观，据说没有一个真正的驾驶员不想驾驶它的。而这架飞机就是停在那里要让这位德国人去驾驶的。空军制定欺骗计划的人员在驾驶舱中放了一套假地图。驾驶舱的门开着。四周空无一人。这个德国人可以容易离开受审讯的那个办公室（皇家空军情报官没有锁门），爬上驾驶舱、起飞。但是，据温盖特说，这个德国人一动也不动地坐在窗子旁边，眼望那架喷火战斗机，耐心地等待着那位情报官返回办公室。
众所周知，德国空军在1944 年春大空战中遭到惨败。但惨败到什么程度呢？对此有相反的说法，但在这关键的时刻“超级机密”不能为最高司令部提供关于德国空军战斗序列的准确估计。实际上，对德国空军实力和战斗力的估计“相差十分悬殊”。正如美国官方的“横跨海峡的进攻”的历史书上所记截的，“这些估计像变戏法一样”。估计之所以有差距是有了几种原因的。盟国远征军最高司令部是知道的。原因之一就是美国和英国空军情报局之间的相互竞争和对“超级机密”所能提供的关于德国空军的情报实行严格的保密措施。但是，德国人也越来越狡猾了；情报和反情报的斗争进行的时间长得足以使德国空军也学会了如何保守机密。结果在五角大楼和空军部之间对德国的空军实力的估计存在着根本不同的意见。后来事实证明这两种意见到头来都言过其实。因此，当进攻日即将来临之时，最高司令部却产生了严重的不安情绪。这种不安情绪对司令部制定的所有计划都产生了影响。
虽然已经进行了进攻前的大规模空战，德国空军仍旧是执行“尼普顿”计划的严重威胁。空中行动，包括后来证实“坚韧”计划是假的那些行动也进一步加强了。1944 年4 月1 日至6 月5 日之间盟国空军对法国北部和比利时的日标，轰炸了二十多万次，投下二十万吨炸弹。甚至在这次战役还没有结束之前，效果就非常可观了。但是，代价也是令人伤心的。这次空中闪电战的最后几个星期中，盟国损失飞行员一万二千多人，飞机二千架。法国和比利时者百姓死亡人数近一万二千人；而盟军和老百姓的伤亡大部分不是在塞纳河以南，而是在塞纳河以北，即“坚韧”计划地区之内。在为进攻部队开辟道路的空中准备过程中，盟军损失的人数几乎同进攻法国的军队损失的人数同样多。这是必要的吗？最高司令官认为是必要的。他向参谋长委员会报告说：“任何一个有助于诺曼底登陆成功的因素都不可放过或忽视。我相信军事形势的发展证明了所作出的决定是正确的”袭击英吉利海峡沿岸的德国雷达站是大举进攻前空中行动的一个极重要的组成部分。对雷达站的袭击也是为“尼普顿”计划和“坚韧”计划服务的。
如果盟军要在登陆日达到出奇制胜的目的，那就必须严重地或彻底地扰乱敌人借以守卫登陆地区的雷达系统。但是，为了掩盖盟军对诺曼底的特殊兴趣，对其他地区的雷达站也进行轰炸，甚至炸得更厉害。这就又增加了这次空中行动的人力和物力的消耗。英吉利海峡岛屿和臭斯但德之间有四十二个雷达站，其中二十六个被炸得无法使用。但是，为了使空战技术以及欺骗技术更加新颖和巧妙，还有意地保留几个雷达站，因为在这一整个时期中，盟军一直在试验并完善一些罕见的策略，准备在登陆日使用。这些策略都与所谓的无线电子干扰有关，是专门用来欺骗保留下来的德国雷达站的。
1944 年4 月和5 月，在俯瞰福思湾的一个岬角上的坦特伦城堡里进行着最后一系列电子干扰欺骗的试验。那里，在城堡的红砖废墟下的一间屋中，电讯研究所和哈伟大学美英第十五实验室的电子科学家们，包括琼·科兰博士在内，在罗伯特·科克伯恩博士的率领下已经把德国武器库中最新式的雷达组装完毕。这个设备是早在1942 年2 月对布伦纳瓦尔人袭击中“抢”来的，井用从非洲、西西里