人总兵德克碑率洋枪队会攻富阳。
9月18日，蒋益澧大举攻打富阳，湘军从水陆两路发起攻击。
9月19日，徐文秀率部渡到江北，夺取城北鸡笼山的新桥。太平军过来争夺，被徐文秀部击退。
徐文秀占据旧垒，背水列营，水师战船在后面护卫，用炸炮轰击城墙。德克碑率领花勇从岭上冲下，杨政谟率领水师合击，从夜间战到天明，炮声不绝。
9月20日，高连升率部攻破新桥的二十座太平军壁垒，湘军攻占富阳。蒋益澧派刘清亮率部驻守新桥，派王月亮率部驻守富阳，自己率领各路部队逼到杭州城下，在清波门和凤山门前扎营。
左宗棠下令，让康国器部和魏喻义部攻打杭州西面六十里处的余杭镇。天国康王汪海洋从杭州出兵西援，康国器率部拦截，将汪海洋部击败。但是，太平军的兵力依然强盛，军营从仓前长桥算起，纵向排列到武林门和北新关，横向排列到古荡，绵延四十里，西达余杭镇。
蒋益澧率部驻扎在留下，命令高连升部驻扎六和塔与万松岭，占据高阜，俯瞰杭州城。
10月18日，太平军从杭州城内出动一万多人，从雷锋塔攻击新营，高连升等部将太平军击退，追击到馒头山。10月20日，高连升部进驻天马和南屏诸山。在杭州以西，魏喻义也率部占据了青山，康国器率部占据宝塔山，逼近余杭镇。
攻打余杭镇的战役首先打响。康国器率部攻破城南的长沙堰卡，然后围攻南门。魏喻义部在石门桥打败太平军。太平军决定死守余杭镇至杭州一线，从余杭东门直至杭州女儿桥一线集结精锐部队，企图绕过何母桥，袭击余杭湘军背后。
11月份，蒋益澧命令刘树元等部在何母桥排列，在天水桥、护国桥、方家桥和太平桥增筑四座壁垒，以阻挡太平军的攻击。
嘉兴的太平军大举增援杭州，趁着漫天雾气，悄悄翻越万松岭，攻击湘军军营。刘志功率部凭借濠沟阻击，高连升领兵赶来援救，德克碑乘浅水轮船夹击，杨政谟率水师登岸作战，将太平军击败。
12月份，左宗棠为了加紧对杭州的攻击，从严州移驻富阳，率领轻骑到余杭督战。将富阳驻军朱明亮等人的五个营，以及分水驻军张声恒的四个营，调到余杭协助攻击。又派刘明珍率领严州驻军的两个营和淳安驻军的四个营，到分水驻防。增援安徽的黄少春部，从分水开往新城，扼守余杭西南。
268
多隆阿部署兵力之后，疾病加剧。他担心朱希广和赵希发轻易出战，临走前一再叮咛，但他担心的事情还是发生了。
回民起义军于7月27日在夜色掩护下凫水渡过渭河，向多隆阿部发起突袭。赵希发自恃骁勇，忍耐不住，忘了多隆阿的告诫，命令部队开壁出击，将起义军击退，然后跟随起义军渡河，攻破起义军的十三座壁垒。朱希广也领军渡到渭河北岸。起义军以一万兵力包抄，击败多隆阿军，击毙朱希广和赵希发。
多隆阿听说部队大败，一恨赵希发和朱希广不听命令，轻易出战，二恨将士作战不够勇猛。他叫人用轿子抬着他到交口，于7月31日亲自指挥作战，对起义军发起三面围攻，还动用炮船助战，杀死几百名起义军。起义军撤进堡垒，闭门不出。
8月20日，多隆阿军攻克葡萄洼和拜家村。
8月24日，多隆阿军攻克三府里，将白鸭嘴和乌什的回民堡垒几乎全部捣毁。
8月25日，多隆阿部拔掉了起义军的根据地，致使起义军几千名勇士溺死，流水为尸体所阻塞。
到此为止，多隆阿军已肃清省城以东的起义军。
9月4日，多隆阿到达西安，与将军和巡抚商议军事。瑛棨被革职充军，英桂暂代陕西巡抚。
清廷见凤翔和平凉被起义军围攻已久，命令多隆阿拨兵前往驰援。多隆阿派陶茂林率领三千五百人增援凤翔，派曹克忠领兵攻打户县，派穆图阿领兵攻打十三村。至于平凉，多隆阿军仍然是鞭长莫及。。 最好的txt下载网
1863年，同治二年（16）
10月4日，多隆阿率部返回交口扎营。10月8日，多隆阿率部进军普陀原。时逢大雨，部队扎桥渡河。然后，多隆阿命令雷正绾部攻打泾阳和高陵之间的永乐店与塔底，派马升的部队扼守咸阳。
10月10日，穆图善率部攻克十三村，然后进占高陵，留兵戍守。雷正绾部攻克永乐和塔底。
10月16日，起义军从渭河渡过泾河，多隆阿军转移到河北扎营，逼近起义军。起义军趁势发起攻击，多隆阿派骑兵截杀，起义军撤走。多隆阿的骑兵追到长陀湾。
10月19日，多隆阿挥军进攻起义军精锐部队集结地苏家沟，连战四天，于10月22日攻克苏家沟，斩杀五千名起义军，还抓获大批俘虏。接着进军渭城湾，斩杀一万七千人，起义军大部西奔甘肃。
总督熙麟呆在甘肃东部边界的庆阳，护总督恩麟则呆在西边的兰州，起义军所到之处，没有清军阻拦，平凉和固原一带，井舍都成废墟。
陶茂林在眉县击败四川的顺天军，进攻眉县以东的槐芽镇和白家凹，攻占了起义军的堡垒，然后挺进西北方，逼近凤翔，在七里河修筑壁垒，凤郡的形势平静下来。知府张兆栋因防守凤翔而出名。清廷将陶茂林提拔为甘肃提督，多隆阿改任西安将军，三十七岁的天津人曹克忠出任河州镇总兵。
曹克忠领兵渡过渭河，攻击白起营和马家埠，占领这两处以后，关辅一带稍稍平静。
清廷再次下诏，催促多隆阿派兵增援甘肃。陶茂林奉命拔营越过陇县，挥师北上，与雷正绾部一起攻打平凉。
11月17日，四川顺天军攻占周至。11月28日，曹克忠的部队在白吉原打了个大胜仗，起义军西奔固原。11月29日，雷正绾部从永寿北上邠州，也就是现在所说的彬县。起义军解围西撤。
从此以后，陕西的回民起义军为了避免与多隆阿军交战，逐渐向西边转移。
这时，宁夏府发生了汉民与回民的争斗，兵备道侯登云训练民团守备。将军庆瑞认为应该安抚，上奏弹劾侯登云，勒令安民团练部队缴械。这里的宁夏府，就是现在所说的银川。
12月4日，回民起义军攻占宁夏府城，侯登云丧命，汉民全被斩杀。庆瑞就在几里之外的满城，置若罔闻。
12月5日，灵州回民起义，占领州城，攻进满人军营，缴获大量物资，捆载而去。这个灵州，就是现在宁夏自治区的吴忠。
清廷得到报告后，颁下严旨，斥责庆瑞，催促熙麟赶赴兰州接受总督官印。又命令陕西巡抚英桂调拨一千名湘军驻扎陕西与宁夏交界处的定边，命令直隶总督刘长佑挑选两千人组成的劲旅，由提督讷钦统领，增援宁夏。
自从1862年陕西发生回民起义以后，起义军派人四出联络，于是甘肃东北部义军四起，在灵州与固原之间的同心城，以及同心城东南方约一百里处的预旺城，都有回民举起义帜。同州城西南约三十里处有个金积堡，###教哲派第五代教主马化龙在这里举起反清义旗，设立碉卡，训练部队。
起义军攻占宁夏府城后，姓赫的首领派使者迎接马化龙进城，回民们跪在道路左侧，俯首听命。
马彦龙和马占鳌在兰州西南约两百里处的和州起义，向东进军，攻占狄道，即现在所说的临洮。在兰州以西，则有马桂源和马本源在西宁起义，赶走总兵和知府。马桂源自任西宁知府，马本源自封西宁镇总兵，办事大臣玉通无法制止。后来马文禄占据肃州，即现在所说的酒泉，自称兵马大元帅。兰州东南方的岷县、渭源、临洮和东方的安定、会宁、静宁，以及西南部的循化，都有回民起义。甘肃从西到东，都燃起了起义的火焰。
面对甘肃全省的起义军，多隆阿感到兵力不足。他得知湘军在江苏已对天京合围，东南战事渐渐顺利，便请清廷让两江总督和巡抚抽调兵力赶赴陕西，并且催促石清吉的湘军向西开进。
269
多隆阿的部队一直在西安周边作战，由于多隆阿本人一直是抱病指挥，而清廷还要他兼顾甘肃的军事，因此他对于陕西南部的起义军，实在是无力兼顾。
骆秉章推荐的能人李云麟，由于母亲去世，回归乡里。清廷将陕西南部的军务交给刘蓉指挥。8月12日，清廷命令骆秉章派部队跟随刘蓉增援陕西南部。8月15日，清廷任命刘蓉为陕西巡抚。在刘蓉到任之前，由陕西按察使张集馨代理职务。
1863年，同治二年（17）
清廷命令刘蓉率领先后增援陕西的所有部队，先去解汉中之围。汉中是个繁荣富裕的大郡，自从四川顺天军会同陈玉成的残部，与当地起义军联合，环城修建军营，城内已是壁垒森严。
毛震寿胆小怕事，借口军饷难以为继，辞去官职。援军中都是武将，拿不出对策，互相观望，让起义军有了喘息的时间。顺天军占据洋县以后，已经引得几十万名起义军从湖北开来，直接进军汉中。毛震寿率部驻扎汉中东北方五十里处的城固，顺天军屡次从东北方的洋县前来攻击，毛震寿为了自保，奋力将顺天军击退。
许多百姓为了躲避起义军，相继入城寻求庇护，城内粮食日益匮乏，疾疫流行，有时一天死去上千人。守城的部队经常出战，援军却不进攻，只是等待统帅到来。
毛震寿见汉中被太平军围困已久，带领三千人去攻打东关，指望打通运粮进城的道路。易佩绅率部前来援助。东关的太平军拥有七八万兵力，将毛震寿和易佩绅的部队包围，致使两军损兵折将。易佩绅率部突围而出，逃到十八里铺，又被起义军打败。
汉中知府张光澍找川军求援，张由庚徘徊不肯进军。张光澍十分气愤，领着自己的部队与太平军作战，落败而归。于是汉中断绝了外援，从汉中到褒城和勉县一带，太平军的势力绵延二百多里。
汉中知府和道员先后病死，城内只有都司、护总兵及南郑令，彼此关系紧张。奉命招募收容散兵多达一万人，每天吃掉一百石大米。
骆秉章得知陕南军情紧急，派何胜必、萧庆高和朱桂秋三位湘军将领，率领一万三千人，随同刘蓉北征，粮食和武器装备都由四川省供应。
耒阳人刘厚基奉命率领湘果营开往陕西。
石达开余部称为中旗的部队，从四川平武进入甘肃后，又从甘肃东进陕西，与陕南的顺天军和太平军会师。中旗部队打的是翼王旗号，分别驻扎在汉中以西的定军山和圆墩子。起义军各部之间由于争夺粮食而发生战斗，将领们之间互相猜忌。于是，陈得才与天将马融和不想留在这里窝里斗，打算率部东进，增援天京。
天国启王梁成富由于有伤在身，发誓要夺取汉中。增王赖汶光率部驻扎在汉中西北，端王蓝成春率部驻扎在汉中东南。
顺天军和从湖北开来的起义军互相猜忌，洋县起义军怀疑外来的起义军想把他们吞并，所以不肯合兵。顺天军听说湖北清军将要开到，联合陈得才部，长驱向东，攻占镇安。
9月下旬，在清廷的催促下，李云麟率部到达襄阳，派李桓所部一千五百人驻扎兴安。9月24日，刘蓉领兵从成都出发。
骆秉章派往陕南增援的部队中，张由庚部进驻云峰寺，易佩绅部扼守两河口，萧庆高与何胜必两部进驻高家岭，以增援汉中。周达武部到达大安驿，以攻打汉中西北面的褒城和勉县。
9月26日，何胜必等将领商议道：“汉中起义军人数虽多，但各怀心志，人心不齐，可以一战把他们赶走。刘公料想我们即将大功告成，所以抢先赶来，把功劳归在他自己名下，我们应该赶在他到来之前，破贼立功。”
于是，何胜必和萧庆高约好朱桂秋和张由庚等部一起进兵。何胜必的部队刚到油坊街，听说朱桂秋等部失约，已先撤退，他也收军返回军营。
9月27日和28日，连日降雨，围城的起义军担心湘军乘机发动攻击，便备好马驮，打算撤走。
汉中城内早已断绝了粮食，守城部队见援军不战自退，更加人心惶惶，便打开北门出逃。
起义军疑心重重，不敢进城，等了很久，不见有什么动静，便纵兵掠杀，进占汉中。
10月12日，萧庆高率领中军攻打油坊街，何胜必和张由庚率部从左路出击，易佩绅和朱桂秋率部从右路出击。刚刚进入油坊街，起义军如潮水般涌来，褒城和勉县的起义军又从汉中以西的新集包抄过来，首先击溃了张由庚的部队，从四川来的各路援军闻风丧胆，纷纷溃逃。起义军趁势进逼，援军残部背水抵抗，溺死者和被斩杀者不计其数。
逃跑的城内百姓，也全部被俘或被杀。
10月24日，起义军又攻占汉中以东的城固。